Le FC Nouadhibou a été créé en 1999 dans un contexte de situation sportive catastrophique dans cette ville à l’époque, capitale économique de la Mauritanie. Un groupe de jeunes dont Aziz Boughourbal, Hanine Boughaleb et Ahmed Yahya (premier président du club) décident alors de créer un club avec comme objectif d’avoir une formation qui permette de représenter le football mauritanien au niveau national mais aussi continental. Le club s’engage en deuxième division lors de la saison 1999-2000.
Depuis sa création, le Club Orange a remporté de nombreux titres locaux, ce qui en fait, dans sa deuxième décennie, le club le plus titré de Mauritanie.
Aujourd’hui, ce club est l’un des meilleurs de Mauritanie, et sans doute le meilleur en ce qui concerne l’organisation car, il dispose de toutes les infrastructures de grands clubs africains (Siège moderne, Centre de formation de niveau, Logement de très haute classe, Restaurant, Salles de musculations…).